飛行器先進設計技術國防重點學科實驗室隸屬南京航空航天大學航空宇航學院，依托南京航空航天大學飛行器設計國家重點學科。南京航空航天大學飛行器設計專業始建于1952年。飛行器設計學科于1981年首批獲得博士和碩士學位授予權，1988年設立了博士後流動站，1998年首批設立了“長江學者”特聘教授崗位。1987年首批被批準為全國唯一的飛行器設計國家重點學科，2001年又以總分第一名再次被評為國家重點學科，2007年通過了教育部的重點學科評估考核。

本學科已先後自行成功研制了我國第一架大型無人駕駛靶機（長空一号）和第一架鴨式布局全複合材料結構的輕型飛機。“十五”期間又成功研制了我國第一架飛翼式微型飛行器、可控撲翼飛行器和一種地效飛行器。到目前為止，本學科共成功研制了21種型号的各類飛行器，已形成飛行器設計技術研究、新概念研究的科研體系，共獲得國家發明獎和國家科技進步一、二、三等獎14項、省部級科技進步獎200多項，共出版學術專著30多部，發表學術論文2000多篇。

該實驗室前身是飛機設計技術實驗室，2007年被國防科工委批準為國防重點學科實驗室。實驗室以先進飛行器發展需求為牽引，定位于新概念飛行器設計和飛行器先進設計理論與技術的研究。在飛行器總體綜合設計理論與技術、飛行器結構綜合設計理論與技術、飛行器系統設計理論與技術等方面深入開展基礎與應用基礎研究、技術創新與型号研制關鍵技術攻關，為我國新型飛行器研制提供強有力的技術儲備，是我國在該領域的科研與人才培養基地之一。實驗室的主要研究方向與研究内容有：飛行器總體綜合設計理論與技術、飛行器結構綜合設計理論與技術、飛行器系統設計理論與技術。實驗室現有教學科研人員27人，其中教授/博導10人，副教授11人。具有博士學位的教師24人，45歲以下教師占79%，長江學者學者1名，“21世紀千百萬人才”1名，教育部“新世紀優秀人才”1名。實驗室已組建了3個高水平學術研究團隊。